Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CtsfQ9R013 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CtsfQ9R013 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CtsfQ9R013 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtsfQ9R013 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtsfQ9R013 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms