Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ripk3Q9QZL0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ripk3Q9QZL0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ripk3Q9QZL0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ripk3Q9QZL0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ripk3Q9QZL0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ripk3Q9QZL0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ripk3Q9QZL0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ripk3Q9QZL0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ripk3Q9QZL0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ripk3Q9QZL0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ripk3Q9QZL0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ripk3Q9QZL0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ripk3Q9QZL0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ripk3Q9QZL0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ripk3Q9QZL0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ripk3Q9QZL0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk3Q9QZL0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ripk3Q9QZL0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ripk3Q9QZL0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ripk3Q9QZL0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms