Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk1eQ9JMK2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csnk1eQ9JMK2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csnk1eQ9JMK2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms