Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cacna1fQ9JIS7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacna1fQ9JIS7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cacna1fQ9JIS7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacna1fQ9JIS7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacna1fQ9JIS7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacna1fQ9JIS7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacna1fQ9JIS7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacna1fQ9JIS7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacna1fQ9JIS7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacna1fQ9JIS7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacna1fQ9JIS7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacna1fQ9JIS7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacna1fQ9JIS7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacna1fQ9JIS7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacna1fQ9JIS7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacna1fQ9JIS7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacna1fQ9JIS7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacna1fQ9JIS7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacna1fQ9JIS7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cacna1fQ9JIS7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cacna1fQ9JIS7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Cacna1fQ9JIS7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms