Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW9

Aldh1a3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a3Q9JHW9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aldh1a3Q9JHW9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a3Q9JHW9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a3Q9JHW9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aldh1a3Q9JHW9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh1a3Q9JHW9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh1a3Q9JHW9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh1a3Q9JHW9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh1a3Q9JHW9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh1a3Q9JHW9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh1a3Q9JHW9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh1a3Q9JHW9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh1a3Q9JHW9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh1a3Q9JHW9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh1a3Q9JHW9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh1a3Q9JHW9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms