Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS9

Cwc15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc15Q9JHS9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cwc15Q9JHS9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cwc15Q9JHS9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc15Q9JHS9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc15Q9JHS9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc15Q9JHS9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc15Q9JHS9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc15Q9JHS9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc15Q9JHS9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc15Q9JHS9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc15Q9JHS9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc15Q9JHS9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cwc15Q9JHS9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cwc15Q9JHS9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms