Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9DA42 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9DA42 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9DA42 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9DA42 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9DA42 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9DA42 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9DA42 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9DA42 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9DA42 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9DA42 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9DA42 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9DA42 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9DA42 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9DA42 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9DA42 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9DA42 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9DA42 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9DA42 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9DA42 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9DA42 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9DA42 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9DA42 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9DA42 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9DA42 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9DA42 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9DA42 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9DA42 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9DA42 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9DA42 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9DA42 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9DA42 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9DA42 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9DA42 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9DA42 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9DA42 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9DA42 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9DA42 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9DA42 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9DA42 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9DA42 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9DA42 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9DA42 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9DA42 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9DA42 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9DA42 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9DA42 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9DA42 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9DA42 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9DA42 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9DA42 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9DA42 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9DA42 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9DA42 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9DA42 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9DA42 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9DA42 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9DA42 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9DA42 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9DA42 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9DA42 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9DA42 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9DA42 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9DA42 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9DA42 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9DA42 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9DA42 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9DA42 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9DA42 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9DA42 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9DA42 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9DA42 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9DA42 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9DA42 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9DA42 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9DA42 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9DA42 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9DA42 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9DA42 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9DA42 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9DA42 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9DA42 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9DA42 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9DA42 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9DA42 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9DA42 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9DA42 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9DA42 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9DA42 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9DA42 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9DA42 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q9DA42 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9DA42 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9DA42 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9DA42 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9DA42 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9DA42 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9DA42 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9DA42 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9DA42 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms