Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem88Q9D0N8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms