Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nsfl1cQ9CZ44 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nsfl1cQ9CZ44 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nsfl1cQ9CZ44 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nsfl1cQ9CZ44 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nsfl1cQ9CZ44 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nsfl1cQ9CZ44 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Nsfl1cQ9CZ44 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Nsfl1cQ9CZ44 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nsfl1cQ9CZ44 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nsfl1cQ9CZ44 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nsfl1cQ9CZ44 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nsfl1cQ9CZ44 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nsfl1cQ9CZ44 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nsfl1cQ9CZ44 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nsfl1cQ9CZ44 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nsfl1cQ9CZ44 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nsfl1cQ9CZ44 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nsfl1cQ9CZ44 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nsfl1cQ9CZ44 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nsfl1cQ9CZ44 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nsfl1cQ9CZ44 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nsfl1cQ9CZ44 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nsfl1cQ9CZ44 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nsfl1cQ9CZ44 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nsfl1cQ9CZ44 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nsfl1cQ9CZ44 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nsfl1cQ9CZ44 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nsfl1cQ9CZ44 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nsfl1cQ9CZ44 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nsfl1cQ9CZ44 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nsfl1cQ9CZ44 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nsfl1cQ9CZ44 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nsfl1cQ9CZ44 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nsfl1cQ9CZ44 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nsfl1cQ9CZ44 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nsfl1cQ9CZ44 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nsfl1cQ9CZ44 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Nsfl1cQ9CZ44 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nsfl1cQ9CZ44 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Nsfl1cQ9CZ44 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nsfl1cQ9CZ44 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nsfl1cQ9CZ44 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nsfl1cQ9CZ44 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nsfl1cQ9CZ44 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nsfl1cQ9CZ44 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nsfl1cQ9CZ44 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nsfl1cQ9CZ44 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nsfl1cQ9CZ44 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nsfl1cQ9CZ44 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nsfl1cQ9CZ44 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nsfl1cQ9CZ44 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nsfl1cQ9CZ44 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nsfl1cQ9CZ44 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nsfl1cQ9CZ44 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nsfl1cQ9CZ44 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nsfl1cQ9CZ44 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nsfl1cQ9CZ44 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nsfl1cQ9CZ44 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Nsfl1cQ9CZ44 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms