Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR26

Vta1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vta1Q9CR26 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Vta1Q9CR26 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vta1Q9CR26 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vta1Q9CR26 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Vta1Q9CR26 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vta1Q9CR26 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vta1Q9CR26 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms