Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SELENOOQ9BVL4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SELENOOQ9BVL4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms