Protein–RNA interactions for Protein: Q99PP6

Trim34a, Tripartite motif-containing protein 34A, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34aQ99PP6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim34aQ99PP6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim34aQ99PP6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim34aQ99PP6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Trim34aQ99PP6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim34aQ99PP6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim34aQ99PP6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trim34aQ99PP6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim34aQ99PP6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim34aQ99PP6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim34aQ99PP6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms