Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pramel1Q99MW3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pramel1Q99MW3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pramel1Q99MW3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pramel1Q99MW3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramel1Q99MW3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms