Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Atp1b4Q99ME6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Atp1b4Q99ME6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Atp1b4Q99ME6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Atp1b4Q99ME6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Atp1b4Q99ME6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Atp1b4Q99ME6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Atp1b4Q99ME6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Atp1b4Q99ME6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Atp1b4Q99ME6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Atp1b4Q99ME6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Atp1b4Q99ME6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Atp1b4Q99ME6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Atp1b4Q99ME6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Atp1b4Q99ME6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Atp1b4Q99ME6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Atp1b4Q99ME6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Atp1b4Q99ME6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Atp1b4Q99ME6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Atp1b4Q99ME6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Atp1b4Q99ME6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Atp1b4Q99ME6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Atp1b4Q99ME6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Atp1b4Q99ME6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Atp1b4Q99ME6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Atp1b4Q99ME6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Atp1b4Q99ME6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Atp1b4Q99ME6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Atp1b4Q99ME6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Atp1b4Q99ME6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Atp1b4Q99ME6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Atp1b4Q99ME6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Atp1b4Q99ME6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Atp1b4Q99ME6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Atp1b4Q99ME6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Atp1b4Q99ME6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Atp1b4Q99ME6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Atp1b4Q99ME6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Atp1b4Q99ME6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Atp1b4Q99ME6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Atp1b4Q99ME6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms