Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clp1Q99LI9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clp1Q99LI9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clp1Q99LI9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clp1Q99LI9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms