Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmp1Q99KU0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmp1Q99KU0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmp1Q99KU0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms