Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmo1Q924W9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmo1Q924W9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmo1Q924W9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmo1Q924W9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmo1Q924W9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lmo1Q924W9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Lmo1Q924W9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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Lmo1Q924W9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Lmo1Q924W9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Lmo1Q924W9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Lmo1Q924W9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Lmo1Q924W9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Lmo1Q924W9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Lmo1Q924W9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmo1Q924W9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Lmo1Q924W9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmo1Q924W9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmo1Q924W9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Lmo1Q924W9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Lmo1Q924W9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Lmo1Q924W9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Lmo1Q924W9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmo1Q924W9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmo1Q924W9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmo1Q924W9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Lmo1Q924W9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmo1Q924W9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmo1Q924W9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmo1Q924W9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmo1Q924W9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmo1Q924W9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmo1Q924W9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmo1Q924W9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmo1Q924W9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo1Q924W9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo1Q924W9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo1Q924W9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo1Q924W9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Lmo1Q924W9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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