Protein–RNA interactions for Protein: Q923S6

Neurl1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1Q923S6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Neurl1Q923S6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Neurl1Q923S6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1Q923S6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1Q923S6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1Q923S6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1Q923S6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Neurl1Q923S6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1Q923S6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1Q923S6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1Q923S6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Neurl1Q923S6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1Q923S6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1Q923S6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1Q923S6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1Q923S6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1Q923S6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Neurl1Q923S6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurl1Q923S6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurl1Q923S6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neurl1Q923S6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.9 ms