Protein–RNA interactions for Protein: Q91V48

Pcdhb21, MCG1033322, mousemouse

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb21Q91V48 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdhb21Q91V48 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb21Q91V48 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb21Q91V48 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcdhb21Q91V48 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb21Q91V48 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb21Q91V48 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb21Q91V48 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb21Q91V48 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb21Q91V48 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb21Q91V48 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb21Q91V48 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb21Q91V48 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms