Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ApobrQ8VBT6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ApobrQ8VBT6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ApobrQ8VBT6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ApobrQ8VBT6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ApobrQ8VBT6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ApobrQ8VBT6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ApobrQ8VBT6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ApobrQ8VBT6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ApobrQ8VBT6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ApobrQ8VBT6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ApobrQ8VBT6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ApobrQ8VBT6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ApobrQ8VBT6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ApobrQ8VBT6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ApobrQ8VBT6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ApobrQ8VBT6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ApobrQ8VBT6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ApobrQ8VBT6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ApobrQ8VBT6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ApobrQ8VBT6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ApobrQ8VBT6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms