Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dnaaf4Q8R368 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Dnaaf4Q8R368 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Dnaaf4Q8R368 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dnaaf4Q8R368 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dnaaf4Q8R368 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnaaf4Q8R368 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnaaf4Q8R368 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms