Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf3c5Q8R2T8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf3c5Q8R2T8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf3c5Q8R2T8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf3c5Q8R2T8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf3c5Q8R2T8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf3c5Q8R2T8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf3c5Q8R2T8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf3c5Q8R2T8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf3c5Q8R2T8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf3c5Q8R2T8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf3c5Q8R2T8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf3c5Q8R2T8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf3c5Q8R2T8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf3c5Q8R2T8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf3c5Q8R2T8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf3c5Q8R2T8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gtf3c5Q8R2T8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms