Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv3Q8K424 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trpv3Q8K424 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms