Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Neil3Q8K203 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neil3Q8K203 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Neil3Q8K203 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms