Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc47a1Q8K0H1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc47a1Q8K0H1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Slc47a1Q8K0H1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc47a1Q8K0H1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc47a1Q8K0H1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms