Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rp1l1Q8CGM2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rp1l1Q8CGM2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rp1l1Q8CGM2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rp1l1Q8CGM2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rp1l1Q8CGM2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rp1l1Q8CGM2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms