Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps53Q8CCB4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps53Q8CCB4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps53Q8CCB4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps53Q8CCB4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps53Q8CCB4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps53Q8CCB4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps53Q8CCB4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps53Q8CCB4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps53Q8CCB4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Vps53Q8CCB4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps53Q8CCB4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps53Q8CCB4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms