Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRK8

Prkaa2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa2Q8BRK8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkaa2Q8BRK8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkaa2Q8BRK8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkaa2Q8BRK8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkaa2Q8BRK8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkaa2Q8BRK8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkaa2Q8BRK8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkaa2Q8BRK8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkaa2Q8BRK8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkaa2Q8BRK8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkaa2Q8BRK8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkaa2Q8BRK8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkaa2Q8BRK8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkaa2Q8BRK8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkaa2Q8BRK8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkaa2Q8BRK8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkaa2Q8BRK8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkaa2Q8BRK8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkaa2Q8BRK8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkaa2Q8BRK8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkaa2Q8BRK8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkaa2Q8BRK8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkaa2Q8BRK8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkaa2Q8BRK8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkaa2Q8BRK8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkaa2Q8BRK8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkaa2Q8BRK8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkaa2Q8BRK8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkaa2Q8BRK8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkaa2Q8BRK8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkaa2Q8BRK8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms