Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcfc2Q8BKT3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcfc2Q8BKT3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcfc2Q8BKT3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gcfc2Q8BKT3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms