Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt12Q8BG71 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trmt12Q8BG71 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt12Q8BG71 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms