Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap100Q80VN0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap100Q80VN0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap100Q80VN0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap100Q80VN0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap100Q80VN0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap100Q80VN0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cfap100Q80VN0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap100Q80VN0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cfap100Q80VN0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap100Q80VN0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms