Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG2

Plxna4, Plexin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna4Q80UG2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plxna4Q80UG2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plxna4Q80UG2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plxna4Q80UG2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plxna4Q80UG2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Plxna4Q80UG2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Plxna4Q80UG2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plxna4Q80UG2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plxna4Q80UG2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Plxna4Q80UG2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plxna4Q80UG2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms