Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cul9Q80TT8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cul9Q80TT8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Cul9Q80TT8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Cul9Q80TT8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cul9Q80TT8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cul9Q80TT8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cul9Q80TT8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Cul9Q80TT8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cul9Q80TT8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cul9Q80TT8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cul9Q80TT8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cul9Q80TT8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cul9Q80TT8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cul9Q80TT8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cul9Q80TT8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cul9Q80TT8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cul9Q80TT8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cul9Q80TT8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cul9Q80TT8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cul9Q80TT8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cul9Q80TT8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cul9Q80TT8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Cul9Q80TT8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cul9Q80TT8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cul9Q80TT8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cul9Q80TT8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cul9Q80TT8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Cul9Q80TT8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cul9Q80TT8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cul9Q80TT8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cul9Q80TT8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cul9Q80TT8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cul9Q80TT8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cul9Q80TT8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Cul9Q80TT8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cul9Q80TT8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cul9Q80TT8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cul9Q80TT8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cul9Q80TT8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cul9Q80TT8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cul9Q80TT8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cul9Q80TT8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cul9Q80TT8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cul9Q80TT8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cul9Q80TT8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cul9Q80TT8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cul9Q80TT8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cul9Q80TT8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cul9Q80TT8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cul9Q80TT8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Cul9Q80TT8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cul9Q80TT8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cul9Q80TT8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Cul9Q80TT8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cul9Q80TT8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Cul9Q80TT8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cul9Q80TT8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms