Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap2lQ7TS74 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap2lQ7TS74 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms