Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyfip1Q7TMB8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyfip1Q7TMB8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyfip1Q7TMB8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyfip1Q7TMB8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyfip1Q7TMB8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyfip1Q7TMB8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyfip1Q7TMB8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyfip1Q7TMB8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyfip1Q7TMB8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyfip1Q7TMB8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyfip1Q7TMB8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyfip1Q7TMB8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyfip1Q7TMB8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyfip1Q7TMB8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyfip1Q7TMB8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyfip1Q7TMB8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms