Protein–RNA interactions for Protein: Q78JE5

Fbxo22, F-box only protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo22Q78JE5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo22Q78JE5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo22Q78JE5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo22Q78JE5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo22Q78JE5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms