Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Glis3Q6XP49 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Glis3Q6XP49 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Glis3Q6XP49 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Glis3Q6XP49 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms