Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bfsp2Q6NVD9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bfsp2Q6NVD9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bfsp2Q6NVD9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms