Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atp11bQ6DFW5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp11bQ6DFW5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp11bQ6DFW5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp11bQ6DFW5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms