Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga3Q62470 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga3Q62470 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms