Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TrhQ62361 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TrhQ62361 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TrhQ62361 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TrhQ62361 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TrhQ62361 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TrhQ62361 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TrhQ62361 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TrhQ62361 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TrhQ62361 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TrhQ62361 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TrhQ62361 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TrhQ62361 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TrhQ62361 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TrhQ62361 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TrhQ62361 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TrhQ62361 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TrhQ62361 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TrhQ62361 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TrhQ62361 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TrhQ62361 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TrhQ62361 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TrhQ62361 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TrhQ62361 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TrhQ62361 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TrhQ62361 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TrhQ62361 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TrhQ62361 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TrhQ62361 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TrhQ62361 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TrhQ62361 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TrhQ62361 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TrhQ62361 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TrhQ62361 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TrhQ62361 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TrhQ62361 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TrhQ62361 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TrhQ62361 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TrhQ62361 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TrhQ62361 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TrhQ62361 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TrhQ62361 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TrhQ62361 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TrhQ62361 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TrhQ62361 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TrhQ62361 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TrhQ62361 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TrhQ62361 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TrhQ62361 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TrhQ62361 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TrhQ62361 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TrhQ62361 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TrhQ62361 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TrhQ62361 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TrhQ62361 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms