Protein–RNA interactions for Protein: Q61084

Map3k3, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k3Q61084 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Map3k3Q61084 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Map3k3Q61084 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Map3k3Q61084 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Map3k3Q61084 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Map3k3Q61084 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Map3k3Q61084 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Map3k3Q61084 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Map3k3Q61084 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Map3k3Q61084 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Map3k3Q61084 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Map3k3Q61084 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Map3k3Q61084 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Map3k3Q61084 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Map3k3Q61084 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Map3k3Q61084 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Map3k3Q61084 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Map3k3Q61084 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Map3k3Q61084 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Map3k3Q61084 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms