Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc55Q3UY51 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrc55Q3UY51 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc55Q3UY51 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc55Q3UY51 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms