Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr1d1Q3UV55 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nr1d1Q3UV55 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1d1Q3UV55 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms