Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syndig1lQ3USQ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syndig1lQ3USQ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syndig1lQ3USQ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syndig1lQ3USQ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syndig1lQ3USQ7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syndig1lQ3USQ7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syndig1lQ3USQ7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syndig1lQ3USQ7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Syndig1lQ3USQ7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Syndig1lQ3USQ7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syndig1lQ3USQ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syndig1lQ3USQ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syndig1lQ3USQ7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Syndig1lQ3USQ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms