Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Sf3b2Q3UJB0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sf3b2Q3UJB0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sf3b2Q3UJB0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sf3b2Q3UJB0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sf3b2Q3UJB0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sf3b2Q3UJB0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sf3b2Q3UJB0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Sf3b2Q3UJB0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sf3b2Q3UJB0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sf3b2Q3UJB0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sf3b2Q3UJB0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sf3b2Q3UJB0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sf3b2Q3UJB0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Sf3b2Q3UJB0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Sf3b2Q3UJB0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.1 ms