Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
YrdcQ3U5F4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
YrdcQ3U5F4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YrdcQ3U5F4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
YrdcQ3U5F4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
YrdcQ3U5F4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YrdcQ3U5F4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YrdcQ3U5F4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YrdcQ3U5F4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YrdcQ3U5F4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YrdcQ3U5F4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YrdcQ3U5F4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YrdcQ3U5F4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms