Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdlim7Q3TJD7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdlim7Q3TJD7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdlim7Q3TJD7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdlim7Q3TJD7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdlim7Q3TJD7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdlim7Q3TJD7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdlim7Q3TJD7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdlim7Q3TJD7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdlim7Q3TJD7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdlim7Q3TJD7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdlim7Q3TJD7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdlim7Q3TJD7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdlim7Q3TJD7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdlim7Q3TJD7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdlim7Q3TJD7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdlim7Q3TJD7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdlim7Q3TJD7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdlim7Q3TJD7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdlim7Q3TJD7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdlim7Q3TJD7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdlim7Q3TJD7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdlim7Q3TJD7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdlim7Q3TJD7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdlim7Q3TJD7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdlim7Q3TJD7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdlim7Q3TJD7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdlim7Q3TJD7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdlim7Q3TJD7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdlim7Q3TJD7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdlim7Q3TJD7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdlim7Q3TJD7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdlim7Q3TJD7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdlim7Q3TJD7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdlim7Q3TJD7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdlim7Q3TJD7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdlim7Q3TJD7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pdlim7Q3TJD7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pdlim7Q3TJD7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdlim7Q3TJD7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms