Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27,48■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27,48■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27,45■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27,39■■□□□ 1,98
Chrna5Q2MKA5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Chrna5Q2MKA5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27,32■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Chrna5Q2MKA5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Chrna5Q2MKA5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Chrna5Q2MKA5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Chrna5Q2MKA5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Chrna5Q2MKA5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Chrna5Q2MKA5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Chrna5Q2MKA5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Chrna5Q2MKA5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Chrna5Q2MKA5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Chrna5Q2MKA5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Chrna5Q2MKA5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Chrna5Q2MKA5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Chrna5Q2MKA5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Chrna5Q2MKA5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Chrna5Q2MKA5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Chrna5Q2MKA5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,5 ms