Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm1123Q1RME4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm1123Q1RME4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm1123Q1RME4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm1123Q1RME4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm1123Q1RME4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm1123Q1RME4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm1123Q1RME4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm1123Q1RME4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm1123Q1RME4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm1123Q1RME4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm1123Q1RME4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm1123Q1RME4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm1123Q1RME4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm1123Q1RME4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm1123Q1RME4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm1123Q1RME4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm1123Q1RME4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm1123Q1RME4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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